SABCS 2020 中国之声丨李惠平教授:中国乳腺癌患者胚系基因突变情况分析

作者:肿瘤瞭望   日期:2020/12/14 11:38:54  浏览量:8682

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编者按:随着医学的进步和发展,基因检测已经被广泛的应用到肿瘤诊断中。对于三阴性的乳腺癌或者家族性的乳腺癌,BRCA基因检测非常重要,它不仅对于诊断有一定的帮助,而且对病情的预测也是有一定的意义。北京大学肿瘤医院李惠平教授团队针对中国乳腺癌人群胚系基因突变情况分析进行分析,并入选SABCS 2020大会上壁报展示,本文就相关内容进行介绍。

研究简介


背景


对乳腺癌患者进行基因检测可能改变患者的常规护理,并转向于更加个性化的治疗策略。检测BRCA1/2基因胚系突变已经成为乳腺癌患者临床治疗的一部分。但是我们对乳腺癌遗传流行病学的理解主要是基于高加索人群的数据,而有证据表明乳腺癌的基因突变可能具有种族特异性。


为阐明中国乳腺癌患者胚系基因突变的情况,我们回顾性分析了2013年1月至2019年12月北京大学肿瘤医院乳腺肿瘤内科收治的356例转移性乳腺癌患者的临床资料,分析有害基因突变与发病年龄、家族史、分子分型及生存的关系。


方法


患者及样本收集


收集2013年1月至2019年12月于北京大学肿瘤医院乳腺肿瘤内科收治的356例复发一线或初治四期、获得知情同意可以采集血液样本的乳腺癌患者的临床资料。从血液样本中分离外周血单核细胞,提取基因组DNA进行二代测序。


二代测序


通过一个涵盖600个基因的panel (PredicineATLAS, Huidu Medical Science Techonology, Inc.)检测胚系基因突变,平均测序深度300×。



胚系DNA检测分析


排除低基础质量、映射分数和其他质量指标的变异。排除等位基因频率<15%或包含不同读数少于8个的变异。重复区的未知变异也被排除在外。根据ACMG标准和指南进行分类,致病性或可能致病性突变在本研究中被列为有害突变。


结论


我们的结果显示,通过600个基因的PredicineATLAS panel检测到的乳腺癌患者的有害突变频率较高的几个基因是BRCA2、BRCA1、ATM和RAD50。与已发表的数据一致,有肿瘤家族史及肿瘤级别高的患者检测到BRCA1突变的概率更高。BRCA1在三阴性乳腺癌中突变频率更高。手术时淋巴结转移多的患者中BRCA2突变的频率更高。通常情况下,生存在不同亚型中有所不同,ER/PR-,HER2+的总生存(OS)最差。有肿瘤家族史的HER2+患者生存结果更差。



本文对中国乳腺癌患者胚系基因突变的情况进行了全面总结。通过600个基因的panel检测出的突变将有助于我们更好地了解中国人群的有害基因突变情况,以及突变对生存的影响。


专家简介

李惠平

主任医师,教授,博士生导师

北京大学肿瘤医院乳腺肿瘤内科主任

中国女医师协会乳腺疾病研究中心主任委员

中国女医师协会临床肿瘤学专业委员会副主任委员兼秘书长

中国临床肿瘤学会(CSCO)执行委员

中国抗癌协会乳腺癌专业委员会常委

《NCCN乳腺癌临床实践指南(中国版)》专家组成员

国家科技部重点项目评审专家

国家自然科学基金评审专家

国家食品药品管理局新药评审专家

 

张嘉扬

北京大学肿瘤医院乳腺内科主治医师   

医学博士

 

王楠

北京大学肿瘤学博士,北京大学肿瘤医院乳腺肿瘤内科住院医师

发表论文:《铂类化疗药物对进展期三阴性乳腺癌的临床疗效及与 BRCA基因突变的关系》发表在《癌症进展》

《Efficiency of platinum in advanced triple-negative breast cancer with germline BRCA mutation determined by next generation sequencing》发表在《中国癌症研究》英文杂志

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版面编辑:洪山  责任编辑:卢宇

本内容仅供医学专业人士参考


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